En el año 1967 la Asociación Nacional de Laboratorios Farmacéuticos, ALAFARPE, creó el Instituto Hipólito Unanue con la finalidad de promover la investigación, la enseñanza y la divulgación científica en el campo de las profesiones médicas y estimular el perfeccionamiento de éstas.

En el año 1982, por considerar al Instituto como entidad fundamental de proyección positiva de la imagen de la Industria Farmacéutica, se decide convertirlo en Fundación.

Son fines de la Fundación promover el estudio, la enseñanza, investigación y divulgación de las Ciencias Médicas en el país, y realizar actividades asistenciales y de auxilio en beneficio de la Comunidad. Con tal finalidad, y sin que la presente enumeración pueda considerarse restrictiva, sino meramente enunciativa, la Fundación lleva a cabo, las siguientes actividades.

• Conceder Préstamos de Honor a universitarios.
• Conceder Préstamos de Post-Grado a profesionales.
• Premiar las labores de investigación y el ejercicio profesional de las Ciencias de la Salud, otorgándose la Medalla de Oro, Premio a la Mejor Edición Científica, y el Premio al Mejor Trabajo de Investigación Científica.
• Auspiciar económicamente Proyectos de Investigación Científica.
• Organizar, auspiciar y contribuir en la realización de Cursos Multidisciplinarios en Provincias.
• Promover y llevar a cabo publicaciones científicas – Revista “DIAGNÓSTICO”.
• Realizar labores de proyección social, sanitaria y actividades asistenciales y de auxilio a la Comunidad.

Por Resolución No. 113-94-JUS/CONSUF del 28 de Junio de 1994, emitida por el Consejo de Supervigilancia de Fundaciones del Ministerio de Justicia, la Fundación Instituto Hipólito Unanue fue reinscrita en el Registro Administrativo Nacional de Fundaciones con el No. 43.